Наука

PNAS: фолдинг белков предсказали на суперкомпьютерах с помощью суперкомпьютеров

Исследователи из Научно-исследовательского центра по развитию суперкомпьютерных технологий представили новую вычислительную платформу APACE, которая использует искусственный интеллект и суперкомпьютеры для быстрого и точного предсказания трехмерной структуры белков.

Белки играют важную роль в биологических процессах, и их функциональные характеристики зависят от уникальной трехмерной формы, которая формируется в процессе сворачивания.

Традиционные методы, такие как рентгеновская кристаллография и криоэлектронная микроскопия, требуют проведения сложных и дорогостоящих экспериментов для изучения структуры белков.

Дерматолог Лукашева: Белки животного происхождения помогут укрепить волосы

Алгоритмы AlphaFold, основанные на искусственном интеллекте, значительно упростили процесс предсказания структуры белков, но требуют значительных вычислительных ресурсов.

APACE оптимизирует работу алгоритма AlphaFold2, разгружая суперкомпьютер от управления данными и равномерно распределяя вычисления между центральными и графическими процессорами.

Это значительно сокращает время предсказания структуры белков, делая процесс в сотни раз быстрее по сравнению с предыдущими методами.

Проведенные тесты на суперкомпьютере Delta с использованием 300 графических процессоров NVIDIA A100 показали, что APACE работает в 100 раз быстрее, чем стандартные версии AlphaFold2.

Это значительно ускоряет процесс предсказания структуры белков и открывает новые возможности для более глубокого изучения их функций, а также разработки новых лекарств.

Ранее «Медздрав.Инфо» сообщал о том, что вымирание динозавров помогло распространению винограда.

Юлия Бондарева

Меня зовут Юлия, я родом из Тулы, обучаюсь на факультете журналистики и занимаюсь написанием новостного контента.

Последние статьи

В ЮУрГУ создан способ вычисления результативности спортсмена до соревнований

Российские исследователи разработали математическую модель, которая позволяет комплексно оценивать физическое состояние спортсменов и прогнозировать изменения…

3 дня назад

Открытие ученых РФ поможет создать терапию для замедления роста раковых клеток

Российские ученые установили, что искусственная активация митохондрий — клеточных структур, отвечающих за выработку энергии, —…

3 дня назад

Ученые выяснили, как селен защищает клетки от повреждений

Исследователи Сеченовского университета совместно с зарубежными коллегами установили, что селен помогает клеткам противостоять воздействию токсичных…

3 дня назад

Зависимость от технологий усилила уязвимость людей перед солнечными вспышками

Усиление зависимости общества от цифровых и технических систем сделало современную инфраструктуру более уязвимой к солнечным…

4 дня назад

Выявлены гены, связанные потенциально с ранним началом болезни Паркинсона

Российские специалисты определили 328 генов-кандидатов, генетические варианты которых могут быть связаны с развитием болезни Паркинсона.…

4 дня назад

Известен химический состав средневековых снадобий из «вытяжки из мумии»

Немецкие исследователи впервые провели анализ состава средневековых лекарственных средств, которые, предположительно, изготавливали из древнеегипетских мумий.…

4 дня назад